Giáo hoàng Innocent IV đã phong thánh cho Thánh Margaret vào năm 1250 để công nhận sự thánh thiện của cá nhân bà, lòng trung thành với Giáo hội Công giáo La Mã, hoạt động cải cách giáo hội và từ thiện. Vào ngày 19 tháng 6 năm 1250, sau khi được phong thánh, hài cốt của bà được chuyển đến một nhà nguyện ở phía đông của Tu viện Dunfermline ở Fife, Scotland.[12] Năm 1693, Giáo hoàng Innocent XII dời ngày lễ của bà sang ngày 10 tháng 6 để công nhận ngày sinh của con trai James VII và II của Scotland và Anh.[11] Trong lần sửa đổi Lịch La Mã chung vào năm 1969, ngày 16 tháng 11 trở nên tự do và Giáo hội đã chuyển ngày lễ của bà sang ngày 16 tháng 11, ngày mất của bà, ngày mà lễ này luôn được quan sát ở Scotland.[13] Tuy nhiên, một số người Công giáo theo chủ nghĩa truyền thống vẫn tiếp tục kỷ niệm ngày lễ của bà vào ngày 10 tháng 6.

Cô cũng được tôn sùng như một vị thánh trong Giáo hội Anh.

Margaret được tưởng nhớ tại Nhà thờ Anh với Lễ hội Lesser vào ngày 16 tháng 11 hàng năm.[14]

Các địa điểm, tổ chứ mang tên bà

Một số nhà thờ trên khắp thế giới được dành riêng để tôn vinh St Margaret. Một trong những lâu đời nhất là Nhà nguyện St Margaret trong Lâu đài Edinburgh ở Edinburgh, Scotland, nơi con trai bà là Vua David I lên ngôi. Nhà nguyện từ lâu được cho là nơi trưng bày của chính Margaret, nhưng bây giờ được cho là mới được thành lập vào thế kỷ 12. Dinh thự lâu đời nhất ở Edinburgh, nó đã được trùng tu vào thế kỷ 19 và được tân trang lại vào những năm 1990. Nhiều tổ chức khác cũng được đặt tên cho bà.

• Địa điểm của Đền thờ Thánh Margaret, hiện tại bị đổ nát tại Tu viện Dunfermline, Fife, Scotland.
• Nhà nguyện Thánh Margaret ở Lâu đài Edinburgh, Edinburgh, Scotland.
• Nhà thờ Thánh Margaret ở Dunfermline, Fife, Scotland.